慢性附睾炎由于纤维增生使整个附睾硬化，显微镜下疤痕非常显著，常可看到附睾管闭塞，组织被淋巴细胞和浆细胞浸润。 严重急性附睾炎不可逆的终末期即为慢性附睾炎，此时可经常出现较急性附睾炎症状轻的表现。

因慢性附睾炎常与慢性前列腺炎同时存在，所以治疗时二病同治。
单用抗生素往往治疗效果不满意，前列腺炎必须控制，如附睾炎反复发作引起前列腺炎应在非发作期行输精管结扎术，前列腺炎可治愈，有时也可行附睾切除术。
(1)注意生活规律化，劳逸结合，忌烟酒及辛辣刺激。
(2)保持大便通畅。
(3)避免长时间久坐。
(4)性生活不宜过频。
(5)温水坐浴，2次／日，水温控制在42℃～50℃，每次20～30分钟。
(6)黄连素或新霉素离子透入。
如果慢性附睾炎有多次反复发作者，可考虑做附睾切除。值得重视的是，无论急性还是慢性附睾炎，如为双侧发生，均有导致不育的可能，故发生附睾炎应及时治疗。